Miraさんの症状（言語バーの非表示）はこちらの環境下では、CCleanerの影響によって引き起こされた事は一度もありません。

言語バーが表示されないのは主に『操作ミス』によるものが主因です。
CCleanerで修正できるものでもなければ、CCleanerが原因となるものでもありません。

以下のリンクが役に立つかもしれません。
https://121ware.com/qasearch/1007/app/servlet/relatedqa?QID=011945
http://answers.microsoft.com/ja-jp/windows/forum/windows_vista-desktop/%E8%A8%80%E8%AA%9E%E3%83%90%E3%83%BC%E3%81%8C/1af32d4b-dc09-49b8-9222-7c40674be931?auth=1


言語バーが表示されないと本当に困りますよね。
私もXPの時代からそういった症状になった事がありますが、CCleanerが原因だった事はなく操作ミスが原因でした。

そもそもCCleanでレジストリ関係を削除する際は安全なもの（本当に不必要なもの）だけがリストアップされるようになっています。IME等のレジストリは基本的には削除されません。（GoogleIMEやMSOfficeアンインストールの場合は別です。）

また念の為、バックアップを取るように促されると思います。バックアップからレジストリを戻しても問題が解決されない場合はCCleanerが原因でない事が立証されます。（CCleaner原因でないと確信していますが）


「バージョンアップでおかしくなったと以前報告しましたが」との事ですが
スタートアップを削除するのでは無くてOption→Settings→Monitoring→(Enable System Monitoring, Enable Active Monitorringのチェックを外す)と設定を変更する事でスタートアップ登録から外す事ができます。

上記リンクやCCleanerバックアップで問題が解決されない場合は
他に危険な臭いがするソフトをインストールされている疑義が濃厚です。
（レビューを見る限りではEaseUS Partition Master Free以外は安全だと思われます。）