先ほどのコメントにおいて、説明不足な部分がありましたので補足します。
Settings画面の件は、実行ファイルだけ取り出して操作した場合のことです。
解凍して出来たフォルダに実行ファイルとFFmpegが同居状態になっているので、
このフォルダを任意の場所に置いて、実行ファイルのショートカットを作成して
ソフト起動すれば、先ほど説明したようなSettings画面の表示はありません。