バージョン５ になってデフラグの時間が長くなったのと、
元々、デフラグ後の断片解消率が悪かったのに更に悪化・ファイルの並びがバラバラですっきりしないのでAuslogics Disk Defrag で断片解消してから実行すると0％まで解消しました。
ブートタイムの機能も一部削減しています。
バージョン４ でダウンロードしてアップデートを無視し続けるか、
defraggler（処理が遅い）をブートタイム専用で利用してAuslogics Disk Defragの利用がいいと思います。