私も不眠対策と疲労軽減に F.lux(ver.4.55) をインストールして使用しています。

手持ちウィルス対策ソフトでの検知結果は以下に。（フルスキャン結果）
Bitdefender Free Edition 検知なし
Avast Free 検地なし
Avira Free 検知なし
Kaspersky Free 検知なし
Comodo Anivirus Free (CISのAntivirus使用)
以上のウィルス対策ソフトウェアでは検知されませんでした。

公式サイトからのインストーラーの検査結果は以下に。
https://www.virustotal.com/#/file/93b0ddf0225ff5f4a867f038965e7f9e5539e48548b4d17a6ebe03be65279795/detection



2017/11/05 21時 現在は問題無いと見ています。

しかしながら最近は愛用していたCCleanerでの電子署名改竄問題があったばかりで、
セキュリティベンダーの対応が遅れている可能性も無きにしもあらずかもしれません。
今後も注視して参ります。

私も拙い知識しか持っておりませんので
このサイトの利用者各位、先輩諸氏のご指摘をいただきたく存じます。