＞ Program Filesにインストールされるようですが、ver2.2はProgram Files (x86)にインストールされる・・・

実体験上、更新のたびに「セットアップ先が代わる」ようです。
クリーンインストールの観点で「上書き更新」をしないようです。
セットアップファイルが、どちらに登録されても問題ないようです。
＞ 入手前に、削除（Remove：Uninstall）しておくか、不要な方を削除すれば OK ですが、旧版は無効扱いになるので放置しておいても機能上は問題ないようです（多少なりとも無駄な存在ですが）。