＞Version28.2.2 で Tools内のOptionが消えて復活できません。optionを戻す方法は？
投稿文からは、状況が判然としないのですが …
Tools、Option をキーワードに：
ここ 3ヶ月、もっぱら「Tor Browser」を常用しており、テスター（試験運用）的に「Brave beta」を併用している程度なので、その他（Pale Moon など）には疎いのですが、
当方の実装版「Pale Moon 28.2.2 /64bit（en-US 仕様）」では、Firefox の「Option」に相当する項目は「Preferences」です。
また「Tools」項目は、Menu Bar を表示時の選択肢になっています。
http://www.palemoon.org/faq.shtml#Preference_4.x:_Restore_menu_bar
Preference: I prefer to use the old style menu bar.