私は、Exif情報の削除では『Free EXIF Eraser』を使用しています。
上記のアプリは、Exif情報をバッサリ全て削除してくれるので、大変重宝しています。

この『ExifCleaner』は、GPS情報など一部のExif情報を削除してくれますが、削除後のファイルを確認したところ【ファイル】の保存場所等が削除されず残っていました。

Linux対応という事で試用してみました。
飽くまでGPS情報の削除を重要視するのであれば、D&Dで手軽に削除できますのでお勧めかと思います。