いくつかこの様なアプリを試用してきましたが、基本期には操作性は大差がない様に感じています。
私は、今回「ツールバー」に焦点を当ててみましたが、どの様なシーンで使用するのかが重要な判断ポイントになる様に感じます。

比較的大きな画面でプレゼンする際は、ツールバーを操作する為に、何度も腰を屈める動作は非常に苦痛を感じますので、ツールバーは肩のライン上が体に負担がなくベターに感じました。

また、
(1)概ね人は右利きですので、基本的に立ち位置は左開き(左肩を前)にする立ち位置か、体を正面した立ち位置になる事が多い。
(2)(聞き手側から見て)画面の左側に立ってプレゼンをする場合も多い。
(3)日本語の資料の場合、基本的に日本語は左側から記入する。
ので、ツールバーは左端に縦である方が動きやすいです。
状況によって様々な位置に移動させられるのもいいと思いますが、固定で操作するのなら、私は左側が操作しやすいと感じています。

勿論、何度か右側にある別アプリも使用しましたが、プレゼン時の姿勢がどうしても左開き(左肩前)になってしまうため、ツールバーが右側にあると背中側になることが多かったので、使いづらく感じました。