レビューありがとうございます。
・フォントサイズの設定
等幅ではないフォントを使用して秒数表示をしていると、1秒ごとにフォントサイズが変わってしまうので固定したいです。
→現状対応方法が思いつきません。いい案が思いついたら対応したいと思います。

・クリックスルーモード
意図しないタイミングで時計を移動してしまったり設定画面が出てしまい、少々目障りです。ゲームモードやデフォルトポジションは試しましたがそもそも触れないようにしたいです。何かキーを押した時だけクリックできる（またはタスクトレイのアイコンからしかアクセスできなくなる）ような機能がほしいです。
→次回リリースで対応します。クリック無視モードを追加
※共通設定＞基本「クリック無視モード」で切替

・日時の書式設定
英数字のみのフォントを使用すると曜日が表示されず、言語をEnglishにしてみましたが月日の順序も海外式になってしまうので、iniの編集などでymdを自由に設定できると嬉しいです（もしくはプリセットとして曜日の英字表記が選べるなど）。
→言語を切り替えた際にそのロケールでの標準的な年月日表示に自前で変換しています。
いずれプリセットでの年月日表示を選択できるように対応したいと思います。