Githubの Discussion に似た報告がありますね。
（https://github.com/ramensoftware/windhawk/discussions/777）
こちらでは Windhawk が終了・アンインストールできなかったようです。

その人によれば、以下のような手順で解決した、と言っています。

1. 一時的なフォルダを作成して メインの exeファイル以外をそこに移動させる
2. 再起動して Windhawk が起動していないことを確かめる
3. 移動させたファイルを元の場所に戻し、uninstall.exeを起動させる

同様の事象が起きた方のために、共有しておきます。