さて、当方7Pro 32bit SP1、Fx13.0.1、Flash11.3.300.265でなんの問題もなく動作しています。Youtube再生も正常で、Flash広告や画像も今まで通り表示されます。
当方の特徴としては、サブブラウザと言うこともありFlashやJava、Silverlightといった一般的なプラグイン以外、全くアドオンを入れていません。PDFビューアはFoxit J-Readerを使っているので、Adobe Readerなどという欠陥ソフトは使っておらずもちろんプラグインも入れていません。
個人的な経験からは、Fxの不具合は大半がアドオンに起因しているように思います。参考になりましたら。