追記です。
Spybot PortableとSpyware Blasterの免疫かけ直したら、34MB以上に戻りました。
免疫かける前にレジストリエディタ開いて、マイコンピュータを選択し、
レジストリのまるごとバックアップをとっておいたので、レジストリ全体ではどれくらい差があるのか比べてみました。
免疫かける前が52,497KB、かけた後が90,924KB、免疫かけただけで38MB以上増えてる。
ちなみにSpybotの方が影響でかいです、今のところ、このソフトを使って不具合は出てません。
デフラグ機能は、実行前に検査だけできるので、気になる方は試してみては。